家庭种菜常见的一个问题是小菜圃等种植蔬菜时间稍长，容易出现病虫害，烂根枯叶等病症时常发生。出现这种情况，重要原因之一是土壤已经带有大量害虫或是病菌。为了减少病虫害发生，需要对土壤进行消毒杀菌杀虫。家庭种菜往往是在阳台或是天台进行，阔绰点的都市家庭才会有庭园种菜，因此，对土壤进行杀虫杀菌不宜用普通农药进行，需要用绿色环保的无公害方法。
方法/步骤
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家庭种菜的规模不大，不能采用标准的休耕方法来减少土壤病菌，否则没有地方可种了。但并不是没有变通办法，可以不连作蔬菜，一季蔬菜采收后不要立即再种植蔬菜，而是把容器里的土壤翻晒一段时间（一个月左右），期间不要让土壤沾水，这样能杀灭大部分病菌虫卵。
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换土也是避免病菌的好方法，只需要对装土的容器在烈日下暴晒一周，即可换装新土种植蔬菜。换土的时候，注意要选择那些没有种植过蔬菜的土壤。
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如果喜食辣椒的家庭，则可以采用轮作的方法来杀虫菌。对于病虫害比较多的地块或是容器，采收完蔬菜后，就种一季辣椒，下一季再种其他蔬菜。辣椒的根系能分泌一系列物质，可以杀灭和驱赶一些病菌和害虫。种的辣椒越辣，杀灭病虫害的效果越好。
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换土和休耕只能适用于部分家庭，对于大多数家庭来说并不现实，因此还是得用药物杀虫害。生石灰是常用的无公害虫菌灭杀剂。对于未采收的蔬菜，可以在土壤表面撒一些生石灰粉，注意不要撒到叶片和根部上，防止烧苗。蔬菜已经采收完毕的容器或是地块，则可以多撒点生石灰粉，撒后翻拌均匀，放置一周后再种菜。
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也可以在采收后对土壤拌辣椒粉消毒杀菌虫。用的辣椒越辣效果越好，最好是自己买的干辣椒来制粉，市场上现成的辣椒粉很多都掺假，效果不好。辣椒粉均匀拌入土壤里，然后洒一些水让土壤湿润，闲置一周后即可种植蔬菜。此外，这个辣椒粉也算是在土里沤肥了。
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茶麸里的茶皂素等物质，能有效杀灭很多病菌和害虫，此外，茶粕也是优质的有机肥，使用茶麸灭虫均可谓一举多得。购买回来的茶麸碾碎成粉末，均匀拌到土壤里，然后洒些水让土壤湿润，等候一周后即可种植蔬菜。
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皂荚或是苦柬树和皂树的枝叶也含有杀灭病虫害的物质，因此，可以采集它们来熬水，然后把开水均匀浇到种菜容器里，放置一周后即可种菜。
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